Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HERC2P3Q9BVR0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERC2P3Q9BVR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms