Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP58Q9BVL2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP58Q9BVL2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms