Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF20Q9BVI0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHF20Q9BVI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHF20Q9BVI0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms