Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
WDR18Q9BV38 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR18Q9BV38 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms