Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB6Q9BUF5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB6Q9BUF5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB6Q9BUF5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms