Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDUFAF3Q9BU61 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDUFAF3Q9BU61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms