Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TINF2Q9BSI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TINF2Q9BSI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TINF2Q9BSI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms