Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C2orf88Q9BSF0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms