Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPKQ9BS16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPKQ9BS16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms