Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCD2LQ9BRP1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2LQ9BRP1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2LQ9BRP1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms