Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEC22CQ9BRL7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC22CQ9BRL7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC22CQ9BRL7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms