Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C20orf78Q9BR46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C20orf78Q9BR46 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms