Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RETNLBQ9BQ08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RETNLBQ9BQ08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms