Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3GL2Q99962 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3GL2Q99962 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms