Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAT1Q99536 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms