Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PNKPQ96T60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNKPQ96T60 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNKPQ96T60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms