Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM209Q96SK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM209Q96SK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM209Q96SK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms