Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
WRNIP1Q96S55 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WRNIP1Q96S55 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms