Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TEFMQ96QE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms