Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPR78Q96P69 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPR78Q96P69 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms