Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSNARE1Q96NA8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSNARE1Q96NA8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSNARE1Q96NA8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms