Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RILPQ96NA2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms