Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF641Q96N77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF641Q96N77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF641Q96N77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms