Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF778Q96MU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF778Q96MU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms