Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SUSD3Q96L08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD3Q96L08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD3Q96L08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms