Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPZA3Q96KX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPZA3Q96KX2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms