Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNIP3Q96KP6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP3Q96KP6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP3Q96KP6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms