Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMX3Q96JJ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMX3Q96JJ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMX3Q96JJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms