Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG1Q96JA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIG1Q96JA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms