Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC41A3Q96GZ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC41A3Q96GZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms