Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCARF2Q96GP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms