Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALML4Q96GE6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALML4Q96GE6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms