Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTERF3Q96E29 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTERF3Q96E29 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms