Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB3CQ96E17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB3CQ96E17 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms