Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A6EQ96DS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms