Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERP27Q96DN0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERP27Q96DN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERP27Q96DN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms