Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHISA4Q96DD7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHISA4Q96DD7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms