Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB2Q96DC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB2Q96DC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB2Q96DC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms