Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF501Q96CX3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF501Q96CX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF501Q96CX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF501Q96CX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF501Q96CX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF501Q96CX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms