Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EAF2Q96CJ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EAF2Q96CJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EAF2Q96CJ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EAF2Q96CJ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EAF2Q96CJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms