Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTSSAQ969W0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTSSAQ969W0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms