Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKL1Q969V6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKL1Q969V6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKL1Q969V6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms