Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX13Q92968 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX13Q92968 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX13Q92968 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms