Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD2Q92925 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCD2Q92925 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCD2Q92925 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms