Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF3Q92576 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF3Q92576 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms