Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BAP1Q92560 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BAP1Q92560 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms