Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCSTNQ92542 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCSTNQ92542 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCSTNQ92542 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms