Protein–RNA interactions for Protein: Q92523

CPT1B, Carnitine O-palmitoyltransferase 1, muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPT1BQ92523 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CPT1BQ92523 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPT1BQ92523 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms