Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf54Q8WWF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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