Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BRK1Q8WUW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BRK1Q8WUW1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms